清华大学的历史要从1909年说起：1909年在北京成立旅游美学处，同时开始筹建附属学校堂招收第一批留美学生，1901年招收第二批留美学生。
1911年，尤美学校更名为清华学校并首次开学。
1912年更名为清华大学，1925年设立本科系，招收四年制大学生。
1928年，更名为国立清华大学。学校设有文学系、法律系、理学院和工程系。1929年，它成立了文学院、理学院和法学院。1932年，它成立了一所工程学校。1933年，开始招收公派留美学生。
1937年抗日战争爆发时，学校迁至长沙，与北京大学、南开大学联合办学，成立了国立长沙临时大学。1938年迁至云南昆明，更名为国立西南联合大学。1946年，清华大学迁回清华校园恢复办学，成立农学院。
1949年后，梅贻琦总统等人随国民政府迁往台湾省。清华隶属于中央人民政府教育部，更名为“清华大学”。
1952年，我国高校院系调整。清华大学的文学、科学、法律、农业和航空学院被迫离开学校，并被转移到北京大学和其他大学。同时，它吸收了中国其他大学的工程系，使清华大学成为一所多学科的工程大学。
强调的是国家培养工程技术人才，这是大多数校友、学术界和教育界强烈否认的。
1952年11月，蒋南翔出任清华大学校长，积极探索符合中国国情的社会主义高等教育办学道路，在培养全面发展的工程技术和尖端科技人才方面取得了突出成就。
他提出了“力争为祖国健康工作50年”的口号，至今激励着清华人。1952年，清华着手进行“学习苏联先进教育经验”的教学改革，按计划培养技术人才，由学分制改为学年制，延长学制，制定教学大纲。
翻译大量苏联教材，强化基础课程，聘请苏联专家授课。
1958年后，教育领域发起了大跃进。将教育与生产劳动、勤工俭学、教育支农相结合，清华师生承担了密云水库、中国革命历史博物馆等实际工作。1970年招募工农兵，
1977年，恢复高考。自1978年以来，清华大学进入了蓬勃发展的新时期，逐步恢复了理学、经济学、管理学和文科学科，并设立了研究生院和继续教育学院。研究生院成立于1984年。
建立经济与管理学院。1985年，重建理学院，成立继续教育学院。1988年，建筑学院成立。1993年，人文社会科学学院成立。1994年，信息科学技术研究所成立。1996年，机械工程学院成立。在1999年，
原中央工艺美术学院合并组建清华大学美术学院。2000年，土木水利学院成立，公共管理学院成立。医学院成立于2001年。新闻与传播学院成立于2002年。
2003年，401医院和402医院并入清华大学，成为附属医院（华新医院和玉泉医院）。2004年，航空航天学院成立。2006年，北京协和医学院更名为北京协和医学院-清华大学医学部。
马克思主义学院成立于2008年。生命科学学院成立于2009年。2011年，环境研究所成立。在建校一百周年之际，海峡两岸的清华大学（清华大学、清华大学、台湾省）共同举办了与“百年校庆”相关的活动。在2012年，
中国人民银行研究生院并入清华大学，五道口金融学院成立。
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